Kota Parepare merupakan salah satu kota yang sangat kompleks, terdiri dari daerah pesisir, dataran dan sebagian besar daerah perbukitan. Namun Kota Parepare merupakan kota yang memiliki lebih dari satu pelabuhan. Kota Parepare adalah Kota Niaga. Secara geografis, Kota Parepare tepat berbatasan dengan Selat Makassar yang memisahkan Pulau Sulawesi dan Pulau Kalimantan. Dengan demikian, arus lalu lintas antar pulau menjadi salah satu layanan sarana transportasi.
Kota parepare memiliki pelabuhan laut yang terbagi menjadi 3 area, yaitu pelabuhan untuk penumpang, pelabuhan untuk barang dan pelabuhan khusus untuk minyak dan gas bumi. Pada tahun 2014 jumlah penumpang asing yang tiba di pelabuhan Kota Parepare dari pelayaran samudera sebanyak 1.245 orang, sedangkan pada tahun 2013 sebesar 741 orang, tahun 2012 sebesar 492 orang , dan tahun 2011 sebesar 946 orang. Dalam kurun waktu empat tahun terakhir jumlah penumpang asing dari pelayaran samudera mengalami peningkatan, sedangkan untuk penumpang pelayaran nusantara yang tiba di Pelabuhan Parepare sejak Tahun 2012 mengalami penurunan dari tahun ke tahun. Untuk Tahun 2014 jumlah penumpang sebanyak 297.124 orang, menurun dari tahun sebelumnya yang sebanyak 322.109 orang, tahun 2012 sebanyak 340.960 orang, dan Tahun 2011 sebanyak 328.145 orang.
- Pelabuhan Penumpang Nusantara
- Pelabuhan Peti Kemas Cappa Ujung
- Pelabuhan Rakyat Lontange (Pelabuhan Rakyat)
- Pelabuhan Minyak (Pertamina-Tanker)